与 David Shaw 的对话：在一次难得的采访中，David Shaw 讨论了他如何使用计算机科学来解开生物化学的奥秘。

Stephen V. Cantrill - 病患护理中的计算机：机遇与挑战
一位来自纽约市的 29 岁女性凌晨 3 点来到加利福尼亚州的一家急诊室（ED），主诉突发严重的腹痛，将她痛醒。她报告说，她正在加利福尼亚州参加婚礼，并且最近也曾遭受类似的腹痛，最近一次导致了阑尾切除术。急诊医生进行了腹部 CAT 扫描，看到他认为是阑尾切除术后腹腔内的伪影。除了患者能够告诉他的信息外，他对患者的既往病史一无所知；他无法访问阑尾切除术前后的任何影像资料，也无法获得任何其他关于手术记录或随访的重要信息。

Samantha Kleinberg, Bud Mishra - 蜕变：转化系统生物学的未来变革
一天早上，格雷戈里娜·萨姆萨从焦虑的梦中醒来时，她发现自己患上了一些神秘的流感样症状，这些症状没有任何预兆地出现。“我怎么了？”她想。在去看医生之前，她决定更多地了解自己可能患了什么病。她登录到一个网站，在那里她用自己能记住的内容注释了一条时间线。自从三月份以来，她的头痛比平时更多，然后在四月份她开始在锻炼后感到更加疲劳，截至七月份，她还经历了偶尔的记忆力衰退。

James C Phillips, John E. Stone - 使用图形处理器探测生物分子机器
计算机模拟已成为研究生物分子结构和功能的不可或缺的一部分。多年来，并行计算机一直被用于进行这些计算量大的模拟并分析其结果。这些模拟充当“计算显微镜”，使科学家能够观察到分子过程的细节，这些细节太小、太快或太精细，无法用传统仪器捕捉。随着时间的推移，商品 GPU（图形处理单元）已经发展成为大规模并行计算设备，最近，人们已经可以使用流行的 C/C++ 编程语言的方言对其进行编程。

Matthew T. Dougherty, Michael J. Folk, Erez Zadok, Herbert J. Bernstein, Frances C. Bernstein, Kevin W. Eliceiri, Werner Benger, Christoph Best - 使用 HDF5 统一生物图像格式
生物科学需要一种通用的图像格式，该格式适用于长期存储并能够处理非常大的图像。图像在生物学中传递深刻的思想，跨越学科。数字图像始于 50 年前，是一种鲜为人知的技术现象。现在它已成为不可或缺的计算工具。它产生了各种不兼容的图像文件格式，其中大多数已经过时。